പൊതു-സ്വകാര്യ ആശുപത്രികളുടെ പങ്കാളിത്തത്തോടെയാണ് സംസ്ഥാന സർക്കാർ ഹൃദ്യം പദ്ധതി നടപ്പാക്കി വരുന്നത്. ഈ പദ്ധതിയുടെ നടത്തിപ്പിനെക്കുറിച്ച് ചില വിവാദങ്ങൾ ഉയർന്നു വന്നിരിക്കുകയാണ്. സ്വകാര്യ ആശുപത്രികളിലേക്ക് കോടികൾ ഒഴുക്കുന്ന പദ്ധതിയാണിതെന്നാണ് ആരോപണമുയർന്നിരിക്കുന്നത്.